MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p05

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018511	TGA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379792
2	NC_018511	CCA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379792
3	NC_018511	ATA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379792
4	NC_018511	TAT	2	6	538	543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379792
5	NC_018511	AAAG	2	8	567	574	75 %	0 %	25 %	0 %	434379792
6	NC_018511	TTCT	2	8	781	788	0 %	75 %	0 %	25 %	434379792
7	NC_018511	GGT	2	6	840	845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379792
8	NC_018511	TGG	2	6	884	889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379792
9	NC_018511	AGG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
10	NC_018511	CTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379792
11	NC_018511	CTG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379792
12	NC_018511	AGG	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
13	NC_018511	CAG	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379792
14	NC_018511	CAG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379792
15	NC_018511	AGG	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
16	NC_018511	GGGAA	2	10	1518	1527	40 %	0 %	60 %	0 %	434379792
17	NC_018511	TTA	2	6	1548	1553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379792
18	NC_018511	T	6	6	2088	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	434379793
19	NC_018511	A	7	7	2105	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
20	NC_018511	A	8	8	2119	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
21	NC_018511	ATT	2	6	2264	2269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379793
22	NC_018511	GAAA	2	8	2288	2295	75 %	0 %	25 %	0 %	434379793
23	NC_018511	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
24	NC_018511	ATG	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379793
25	NC_018511	ATTG	2	8	2409	2416	25 %	50 %	25 %	0 %	434379793
26	NC_018511	CAG	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379793
27	NC_018511	CAG	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379793
28	NC_018511	CTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379793
29	NC_018511	TCT	2	6	2471	2476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379793
30	NC_018511	A	6	6	2492	2497	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
31	NC_018511	A	6	6	2507	2512	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
32	NC_018511	GCTG	2	8	2713	2720	0 %	25 %	50 %	25 %	434379794
33	NC_018511	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379794
34	NC_018511	A	6	6	2888	2893	100 %	0 %	0 %	0 %	434379794
35	NC_018511	AAAAG	2	10	2914	2923	80 %	0 %	20 %	0 %	434379794
36	NC_018511	ATAA	2	8	3203	3210	75 %	25 %	0 %	0 %	434379795
37	NC_018511	T	6	6	3225	3230	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
38	NC_018511	AAC	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379795
39	NC_018511	T	6	6	3412	3417	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
40	NC_018511	ATT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379795
41	NC_018511	A	6	6	3559	3564	100 %	0 %	0 %	0 %	434379795
42	NC_018511	CTT	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
43	NC_018511	TAC	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379795
44	NC_018511	TAT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379795
45	NC_018511	T	6	6	3654	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
46	NC_018511	TTC	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
47	NC_018511	CCA	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379795
48	NC_018511	TCT	3	9	3727	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
49	NC_018511	CCA	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379795
50	NC_018511	T	8	8	3798	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
51	NC_018511	ATCT	2	8	4056	4063	25 %	50 %	0 %	25 %	434379796
52	NC_018511	CTT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
53	NC_018511	TC	3	6	4159	4164	0 %	50 %	0 %	50 %	434379796
54	NC_018511	T	6	6	4193	4198	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
55	NC_018511	CTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
56	NC_018511	ACTT	2	8	4297	4304	25 %	50 %	0 %	25 %	434379796
57	NC_018511	T	6	6	4303	4308	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
58	NC_018511	TTTC	2	8	4327	4334	0 %	75 %	0 %	25 %	434379796
59	NC_018511	T	6	6	4409	4414	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
60	NC_018511	AAT	2	6	4415	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379796
61	NC_018511	T	7	7	4436	4442	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
62	NC_018511	TTC	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
63	NC_018511	CTA	3	9	4534	4542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
64	NC_018511	CTT	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
65	NC_018511	T	6	6	4630	4635	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
66	NC_018511	TTG	2	6	4691	4696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379796
67	NC_018511	TAC	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
68	NC_018511	CAA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379796
69	NC_018511	CTAATT	2	12	4756	4767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379796
70	NC_018511	GTTT	2	8	4769	4776	0 %	75 %	25 %	0 %	434379796
71	NC_018511	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
72	NC_018511	AATC	2	8	4801	4808	50 %	25 %	0 %	25 %	434379796
73	NC_018511	TTTCTT	2	12	4822	4833	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434379796
74	NC_018511	TC	3	6	4977	4982	0 %	50 %	0 %	50 %	434379796
75	NC_018511	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379796
76	NC_018511	TCA	3	9	5118	5126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
77	NC_018511	TC	3	6	5162	5167	0 %	50 %	0 %	50 %	434379796
78	NC_018511	CTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
79	NC_018511	T	6	6	5201	5206	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
80	NC_018511	GTC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379796
81	NC_018511	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
82	NC_018511	TAG	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379796
83	NC_018511	TCA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
84	NC_018511	CTT	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
85	NC_018511	AAAT	2	8	5406	5413	75 %	25 %	0 %	0 %	434379796
86	NC_018511	TAT	3	9	5467	5475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379796
87	NC_018511	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379796
88	NC_018511	GATT	2	8	5496	5503	25 %	50 %	25 %	0 %	434379796
89	NC_018511	TGA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379797
90	NC_018511	AT	3	6	6114	6119	50 %	50 %	0 %	0 %	434379797
91	NC_018511	TTG	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379797
92	NC_018511	CAT	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379797
93	NC_018511	TTA	2	6	6187	6192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379797
94	NC_018511	CATA	2	8	6219	6226	50 %	25 %	0 %	25 %	434379797
95	NC_018511	A	6	6	6226	6231	100 %	0 %	0 %	0 %	434379797
96	NC_018511	T	6	6	6674	6679	0 %	100 %	0 %	0 %	434379798
97	NC_018511	ATA	2	6	6688	6693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379798
98	NC_018511	TA	3	6	6740	6745	50 %	50 %	0 %	0 %	434379798
99	NC_018511	AAT	2	6	6781	6786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379798
100	NC_018511	TTTAAT	2	12	6826	6837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
101	NC_018511	TGA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379798
102	NC_018511	AT	3	6	6898	6903	50 %	50 %	0 %	0 %	434379798
103	NC_018511	CAC	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379798
104	NC_018511	TGG	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379798
105	NC_018511	CAT	2	6	6962	6967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379798
106	NC_018511	TAT	2	6	6980	6985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
107	NC_018511	ATT	2	6	7000	7005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
108	NC_018511	CAA	2	6	7010	7015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379798
109	NC_018511	TAC	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379798
110	NC_018511	ATT	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
111	NC_018511	ACA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379798
112	NC_018511	TTC	2	6	7095	7100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379798
113	NC_018511	T	7	7	7157	7163	0 %	100 %	0 %	0 %	434379798
114	NC_018511	T	6	6	7216	7221	0 %	100 %	0 %	0 %	434379799
115	NC_018511	CTT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379799
116	NC_018511	ATA	2	6	7328	7333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379799
117	NC_018511	AT	3	6	7360	7365	50 %	50 %	0 %	0 %	434379799
118	NC_018511	TTG	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379799
119	NC_018511	AGG	3	9	7448	7456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379799
120	NC_018511	TA	3	6	7580	7585	50 %	50 %	0 %	0 %	434379799
121	NC_018511	ATAC	2	8	7607	7614	50 %	25 %	0 %	25 %	434379799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.